Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cavin4A2AMM0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cavin4A2AMM0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cavin4A2AMM0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cavin4A2AMM0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cavin4A2AMM0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cavin4A2AMM0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cavin4A2AMM0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cavin4A2AMM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms