Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd60A2AMD2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ankrd60A2AMD2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ankrd60A2AMD2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ankrd60A2AMD2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms