Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lcn6A2AJB9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lcn6A2AJB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lcn6A2AJB9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lcn6A2AJB9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms