Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Frmpd4A2AFR3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmpd4A2AFR3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd4A2AFR3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Frmpd4A2AFR3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmpd4A2AFR3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms