Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930447F04RikA2AFR2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930447F04RikA2AFR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930447F04RikA2AFR2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms