Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561d1A2AE42 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyb561d1A2AE42 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyb561d1A2AE42 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyb561d1A2AE42 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms