Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc39aA2ACP1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39aA2ACP1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39aA2ACP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc39aA2ACP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39aA2ACP1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms