Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Akap17bA2A3V1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Akap17bA2A3V1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Akap17bA2A3V1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Akap17bA2A3V1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akap17bA2A3V1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Akap17bA2A3V1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Akap17bA2A3V1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Akap17bA2A3V1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Akap17bA2A3V1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms