Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1bA1Z198 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1bA1Z198 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1bA1Z198 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp1bA1Z198 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp1bA1Z198 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms