Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRE8

Zscan4e, Zinc finger and SCAN domain-containing 4E, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zscan4eA0A1B0GRE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan4eA0A1B0GRE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan4eA0A1B0GRE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms