Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup205A0A0J9YUD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup205A0A0J9YUD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup205A0A0J9YUD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup205A0A0J9YUD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup205A0A0J9YUD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms