Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm28269A0A087WSG3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,21■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm28269A0A087WSG3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Gm28269A0A087WSG3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms