Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA5

Gm28961, Predicted gene 28961, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28961A0A087WPA5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20,37■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Gm28961A0A087WPA5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,33■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20,28■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Gm28961A0A087WPA5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms