Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm28919A0A087WP35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28919A0A087WP35 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28919A0A087WP35 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28919A0A087WP35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28919A0A087WP35 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28919A0A087WP35 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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