Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SNX13Q9Y5W8 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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SNX13Q9Y5W8 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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SNX13Q9Y5W8 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SNX13Q9Y5W8 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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