Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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