Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LTBP3Q9NS15 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms