Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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