Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms