Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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RTL8BQ17RB0 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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RTL8BQ17RB0 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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RTL8BQ17RB0 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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RTL8BQ17RB0 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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RTL8BQ17RB0 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RTL8BQ17RB0 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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