Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNAPC1Q16533 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNAPC1Q16533 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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