Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms