Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
HERC1Q15751 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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