Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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CHD4Q14839 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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CHD4Q14839 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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CHD4Q14839 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHD4Q14839 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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