Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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COL4A6Q14031 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL4A6Q14031 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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