Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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CNGB1Q14028 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CNGB1Q14028 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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