Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms