Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPTAN1Q13813 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPTAN1Q13813 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
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