Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TUBA3CQ13748 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms