Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PEX6Q13608 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms