Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATRQ13535 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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