Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCIRG1Q13488 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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