Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNTA1Q13424 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms