Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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