Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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