Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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