Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
BPTFQ12830 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
BPTFQ12830 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms