Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms