Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRDP23468 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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