Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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