Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RNF20Q5VTR2 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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