Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRNQ16849 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRNQ16849 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PTPRNQ16849 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRNQ16849 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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