Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SGCAQ16586 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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SGCAQ16586 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SGCAQ16586 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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SGCAQ16586 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SGCAQ16586 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SGCAQ16586 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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SGCAQ16586 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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SGCAQ16586 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCAQ16586 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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