Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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