Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP6AP1Q15904 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms