Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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