Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SS18Q15532 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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SS18Q15532 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SS18Q15532 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SS18Q15532 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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SS18Q15532 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SS18Q15532 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SS18Q15532 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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SS18Q15532 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SS18Q15532 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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