Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SYCP1Q15431 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SYCP1Q15431 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SYCP1Q15431 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SYCP1Q15431 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SYCP1Q15431 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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