Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms