Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms